在选择硕士论文查重软件时，首先要考虑的是软件的价格。不同的查重软件价格各不相同，有的是按照使用时长收费，有的是按照使用次数计费，还有的是一次性购买永久使用权。除了价格，还要考虑软件的性价比，即在合适的价格下获取最大的功能和效果。因此，建议在选择硕士论文查重软件时，综合考虑价格和性能，选择最适合自己需求的软件。

除了价格和性价比，选择硕士论文查重软件还应考虑软件的准确性、检测速度、支持文件格式、用户体验等因素。可以先了解不同软件的免费试用期或者免费查重次数，亲自体验软件的性能和功能，再结合自身需求和预算，选择最适合的硕士论文查重软件。记得在使用过程中及时更新软件版本，以保证查重效果的准确性和及时性。