硕士论文查重后的反思与总结应该首先对论文中存在的重复内容、引用不当等问题进行分析，查找原因并提出改进措施。其次，需要对整个论文写作过程进行回顾，总结经验教训，包括时间规划、资料收集、论文结构等方面。最后，还应对查重结果进行解读，看是否存在不合规范的地方，并进行修改，确保论文质量。

此外，硕士论文查重后的反思与总结还应包括对自身学术诚信的思考，反思自己在论文写作过程中是否存在抄袭、剽窃等行为，如有必须及时改正并警醒自己。同时，还应对导师提出的意见和建议进行认真对待，将其作为提升自身学术水平的重要参考，不断完善自己的论文写作能力。总之，硕士论文查重后的反思与总结是一个自我审视、自我提升的过程，应当认真对待。