在进行硕士论文查重后的修改时，首先要仔细阅读查重报告，了解重复率高的部分。然后，逐一对重复部分进行修改，可以通过更换词汇、调整句式结构等方式进行改写。此外，还可以增加论据、引用更多的资料来丰富内容，降低重复率。在修改过程中，要保持原文意思的完整性，避免出现歧义。最后，务必再次进行查重确认修改效果。

另外，在进行硕士论文查重后的修改时，也可以借助一些查重软件进行辅助。这些软件可以帮助快速定位重复部分，提高修改效率。同时，可以请教导师或专业编辑进行审核，及时纠正不足之处。要注意修改后的论文结构是否合理，逻辑是否清晰，语言表达是否得当。最终完成修改后，再次进行查重确认修改效果，确保论文通过查重，并保持原创性。